Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RTP4Q96DX8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms