Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RSPRY1Q96DX4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RSPRY1Q96DX4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms