Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PABPC5Q96DU9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms