Protein–RNA interactions for Protein: Q96DS6

MS4A6E, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6EQ96DS6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A6EQ96DS6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A6EQ96DS6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms