Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3KBP1Q96B97 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3KBP1Q96B97 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms