Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP4Q969X6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UTP4Q969X6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms