Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHMTQ93088 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms