Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DPF3Q92784 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DPF3Q92784 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms