Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDI1Q8WTU0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDI1Q8WTU0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms