Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM58Q8NG06 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM58Q8NG06 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms