Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APPL2Q8NEU8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms