Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM35BQ8NCS4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms