Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATAD1Q8NBU5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATAD1Q8NBU5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATAD1Q8NBU5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms