Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNBD1Q8NA66 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNBD1Q8NA66 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CNBD1Q8NA66 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CNBD1Q8NA66 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNBD1Q8NA66 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNBD1Q8NA66 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms