Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD2AQ8NA29 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD2AQ8NA29 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms