Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms