Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHTF2Q8N3S3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms