Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML4Q8N228 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML4Q8N228 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms