Protein–RNA interactions for Protein: Q8N118

CYP4X1, Cytochrome P450 4X1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4X1Q8N118 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4X1Q8N118 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4X1Q8N118 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms