Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMNTD2Q8IXW0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms