Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A9Q8IVB4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A9Q8IVB4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms