Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLD3Q8IV08 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PLD3Q8IV08 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLD3Q8IV08 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLD3Q8IV08 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PLD3Q8IV08 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLD3Q8IV08 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLD3Q8IV08 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLD3Q8IV08 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLD3Q8IV08 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PLD3Q8IV08 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLD3Q8IV08 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms