Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV6

TMEM173, Stimulator of interferon genes protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM173Q86WV6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM173Q86WV6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM173Q86WV6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM173Q86WV6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM173Q86WV6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM173Q86WV6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM173Q86WV6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM173Q86WV6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM173Q86WV6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM173Q86WV6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM173Q86WV6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM173Q86WV6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM173Q86WV6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM173Q86WV6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM173Q86WV6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM173Q86WV6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM173Q86WV6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM173Q86WV6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM173Q86WV6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms