Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SKAP1Q86WV1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SKAP1Q86WV1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKAP1Q86WV1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms