Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF3Q86WH2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms