Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPM2Q86SE8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPM2Q86SE8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPM2Q86SE8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms