Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP54Q7Z3B4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP54Q7Z3B4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms