Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX7Q7RTT5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX7Q7RTT5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms