Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT4

SSX8, Protein SSX8, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX8Q7RTT4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX8Q7RTT4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX8Q7RTT4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms