Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRADAQ7RTN6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRADAQ7RTN6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms