Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HS2ST1Q7LGA3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms