Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SV2AQ7L0J3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms