Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE2R2Q712K3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms