Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM47EQ6ZV65 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM47EQ6ZV65 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms