Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN12Q6ZSI9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN12Q6ZSI9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN12Q6ZSI9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms