Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms