Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMV7

LEKR1, Leucine-, glutamate- and lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEKR1Q6ZMV7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LEKR1Q6ZMV7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LEKR1Q6ZMV7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms