Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
FOXD4L3Q6VB84 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FOXD4L3Q6VB84 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms