Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms