Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms