Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC42EP5Q6NZY7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms