Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUM9

RETSAT, All-trans-retinol 13,14-reductase, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETSATQ6NUM9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RETSATQ6NUM9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RETSATQ6NUM9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RETSATQ6NUM9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RETSATQ6NUM9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RETSATQ6NUM9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RETSATQ6NUM9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RETSATQ6NUM9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RETSATQ6NUM9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RETSATQ6NUM9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RETSATQ6NUM9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RETSATQ6NUM9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RETSATQ6NUM9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RETSATQ6NUM9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RETSATQ6NUM9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RETSATQ6NUM9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RETSATQ6NUM9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RETSATQ6NUM9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RETSATQ6NUM9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RETSATQ6NUM9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RETSATQ6NUM9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RETSATQ6NUM9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RETSATQ6NUM9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETSATQ6NUM9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETSATQ6NUM9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETSATQ6NUM9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETSATQ6NUM9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETSATQ6NUM9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETSATQ6NUM9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETSATQ6NUM9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RETSATQ6NUM9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETSATQ6NUM9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETSATQ6NUM9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms