Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CGB2Q6NT52 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms