Protein–RNA interactions for Protein: Q684P5

RAP1GAP2, Rap1 GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GAP2Q684P5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAP1GAP2Q684P5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAP1GAP2Q684P5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms