Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG16L1Q676U5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms