Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ECM29Q5VYK3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ECM29Q5VYK3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms