Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
SUSD4Q5VX71 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SUSD4Q5VX71 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms