Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFI1BQ5VTD9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFI1BQ5VTD9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms