Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYCP2LQ5T4T6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP2LQ5T4T6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms