Protein–RNA interactions for Protein: Q5R3I4

TTC38, Tetratricopeptide repeat protein 38, humanhuman

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC38Q5R3I4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC38Q5R3I4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC38Q5R3I4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC38Q5R3I4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC38Q5R3I4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC38Q5R3I4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC38Q5R3I4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC38Q5R3I4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC38Q5R3I4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC38Q5R3I4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC38Q5R3I4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC38Q5R3I4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC38Q5R3I4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC38Q5R3I4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC38Q5R3I4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC38Q5R3I4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC38Q5R3I4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TTC38Q5R3I4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TTC38Q5R3I4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TTC38Q5R3I4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC38Q5R3I4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
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